Special topics in cell biology and plant biotechnology

ΒΙΟΛ491-ΕιδικΑ κεφΑλαια απεικονιστικΗς και βιοτεχνολογΙας φυτΩν

In English below

Το Ειδικά Κεφάλαια Βιοτεχνολογίας και Απεικονιστικής Φυτών αποσκοπεί στην περαιτέρω μελέτη κυτταρικών μηχανισμών και μεθοδολογιών μελέτης τους. Υπό το πρίσμα αυτό, θα συζητηθούν ή θα προταθούν βιοτεχνολογικές εφαρμογές που βασίζονται στη μοριακή βιολογία και φυσιολογία. Έμφαση επίσης δίδεται σε μη-μοριακές βιοτεχνολογικές εφαρμογές.

Το μάθημα αποσκοπεί  να αναπτύξει την κριτική σκέψη και συνθετική ικανότητα των φοιτητών, να τους εισαγάγει σε σειρά πειραματικών τεχνικών και μεθοδολογιών για την καλύτερη πειραματική προσέγγιση  θεμάτων Βιοτεχνολογίας και ανάπτυξη νέων διεπιστημονικών τεχνολογιών.

Με την επιτυχή ολοκλήρωση του μαθήματος οι  φοιτητές θα:

Έχουν ενημερωθεί για τεχνολογίες αιχμής σχετικές με την αναγνώριση κυτταρικών μηχανισμών που μπορούν να αξιοποιηθούν για τη παραγωγή νέων προϊόντων.

  • Έχουν ενημερωθεί για τις δυνατότητες που παρέχουν οι φυτικοί οργανισμοί για παραγωγή προϊόντων μεγάλης προστιθέμενης αξίας.

Έχουν αποκτήσει γνώσεις, που τους επιτρέπουν να ασχοληθούν με τη δημιουργία παραγωγικών μονάδων για παραγωγή υψηλής προστιθέμενης αξίας βιοτεχνολογικών προϊόντων από τα φυτά.

EN

Special Topics in Biotechnology and Planta Imaging aims at delving into cellular mechanisms and their methodological exploration. Hence, we will discuss or suggest biological applications based on molecular biology and physiology. We will also emphasize in more classical biotechnological applications.

The course aims also to develop the critical thinking of students and introduce them to a series of experimental setups for being able to experimentally approach in a more coherent and mutlidisciplinary way topics relevant to biotechnology.

Upon succesful completion of the course, students will be able to :

Acquire state of the art knowledge in advanced technologies for identification of cellular mechanisms that can be used to produce new products

Acquire knowledge for the advances that plant cells offer for the development of added value products

Acquire knowledge that may allow them to develop or even establish settings in industry

Prerequisites:
Prior knowledge in cell biology and plant physiology is desirable
Recommended reading: Agnès Ricroch, Surinder Chopra, Shelby J. Fleischer. 2014. Plant Biotechnology: Experience and Future Prospects. SPRINGER, ISBN 978-331-906-891-6   -relevant journals Science, Nature, Nature Biotechnology, Nature Plants, PNAS, Plant Cell, New Phytologist, Plant Journal, Plant Physiology, Journal of Experimental Botany, Journal of Biotechnology κ.ά.  
-relevant websites https://www.facebook.com/Teaching-Tools-in-Plant-Biology-175851565771129/  http://www.plantcell.org/content/teaching-tools-plant-biology  

ΔΙΑΛΕΞΗ 1

ερωτήσεις που διατυπώθηκαν:

  1. πότε χρησιμοποιούμε την εκάστοτε τεχνική; ποια τα πλεονεκτήματα και μειονεκτήματά της.
  2. Πώς μπορούμε να παρακολουθούμε in vivo ένα βιομόριο και να παρακολουθούμε τις αλληλεπιδράσεις του;
  3. Από τη θεωρία στη πράξη. Πώς δουλεύει το συνεστιακό για παράδειγμα;
  4. Πράσινη ενέργεια/phytoremediation
  5. Συνθετική βιολογία στα φυτά.
  6. Παθογένεια και μηχανισμοί άμυνας.
  7. Βιοασφάλεια και γονιδιακή επεξεργασία.

Νέα πλαίσια που συζητήθηκαν

Phase separation
P-bodies
confocal microscopy: why do we use it and the basics

Interesting additional read:

ΔΙΑΛΕΞΗ 2

https://imagej.net/Fiji/Downloads

https://biorender.com/

https://rupress.org/jcb/article/166/1/11/34064/What-s-in-a-picture-The-temptation-of-image

https://29a.ch/photo-forensics/#error-level-analysis

https://www.olympus-lifescience.com/en/microscope-resource/primer/anatomy/objectives/